希腊PDO奶酪的扩增子宏条形码微生物组分析

一句话概括

本文首次利用16S rRNA和ITS扩增子宏条形码测序，系统解析了希腊6种PDO(受保护的原产地名称（PDO）)奶酪、共18个不同厂商样品的细菌与真菌群落组成。

研究选取Anevato、Batzos、Galotiri、Feta、Kalathaki Lemnou、Kopanisti六种PDO奶酪，各取三个不同厂商样品，共18份样品测序(p.1,4)。
细菌群落以乳酸菌类（含 Lactococcus、Lactobacillus、Streptococcus、Leuconostoc)为主导，Kopanisti、Batzos物种丰富度最高，Feta、Galotiri最低(p.1,4)。
真菌以Saccharomycetaceae、Dipodascaceae、Debaryomycetaceae科为主，Debaryomyces hansenii是最常见的优势种(p.1,5-6)。
同一奶酪类型的不同厂商样品间微生物组差异显著，未观察到明确的”核心微生物组”，说明发酵剂/辅助菌种及原料奶的差异比奶酪类型本身更能决定微生物群落组成(p.6-8)。
部分样品(如家庭作坊生产的Galotiri_2)检出较高丰度的肠杆菌科及金黄色葡萄球菌，提示小规模生产环节的卫生管理仍需加强(p.7)。

中文	原文
受保护的原产地名称	PDO (Protected Designation of Origin)
扩增子宏条形码测序	amplicon metabarcoding
操作分类单元	OTU (Operational Taxonomic Unit)
内转录间隔区	ITS (Internal Transcribed Spacer)
非度量多维尺度分析	NMDS (Non-metric Multi-Dimensional Scaling)